農学生命科学科

研究成果 

2021.06.18 真核生物のゲノムが新しい遺伝子を獲得する過程の実験的な解明に成功しました (植物ゲノム情報学研究室)

京都府立大学の佐藤壮一郎講師 (植物ゲノム情報学研究室) らと 摂南大学の小保方教授 (ゲノム生物学研究室) の研究チームは、シロイヌナズナを用いた*人工進化実験により、真核生物のゲノムが新しい遺伝子を獲得するとき、その遺伝子の発現 (転写) がどのように行われるのかを明らかにしました。ゲノムのDNA配列が遺伝子として働くためには、通常、「コード配列」と呼ばれるタンパク質を作るための塩基配列と、その配列を転写するための「プロモーター配列」と呼ばれる塩基配列が必要です。今回の研究では、細胞外からのDNAの取り込みなどによって、ゲノムに新たに加わった遺伝子は、プロモーター配列がなくてもコード配列の周囲の特定の位置から転写を始めていることが明らかとなりました。また、このように始められた転写の状態が、次の世代に継承されることもわかってきました。今回の研究から、ゲノムの進化の新しいメカニズムが明らかになりました。   * 人工進化実験 : プロモーター配列を持たないコード配列 (タンパク質を作るための塩基配列) を、人為的にゲノムに大量に導入し、本来はまれにしか生じない「遺伝子の獲得」を高い頻度で生じさせ、長期的なゲノムの進化を短時間で再現した実験。     本研究成果は、国際学術誌「Molecular Biology and Evolution」と「PLOS ONE」に掲載されました。   論文タイトル : Kozak Sequence Acts as a Negative Regulator for De Novo Transcription Initiation of Newborn Coding Sequences in the Plant Genome.   著者 : Takayuki Hata, Soichirou Satoh, Naoto Takada, Mitsuhiro Matsuo, Junichi Obokata.   doi.org/10.1093/molbev/msab069     論文タイトル : De novo activated transcription of inserted foreign coding sequences is inheritable in the plant genome.   著者 : Takayuki Hata, Naoto Takada, Chihiro Hayakawa, Mei Kazama, Tomohiro Uchikoba, Makoto Tachikawa, Mitsuhiro Matsuo, Soichirou Satoh, Junichi Obokata.   doi.org/10.1371/journal.pone.0252674     プレスリリース原稿のリンク(学外サイト) : https://www.u-presscenter.jp/article/post-46039.html

2021.06.11 胃腸伸展刺激による有益作用とその作用機序を解明(動物機能学)

胃腸伸展は、腸ホルモンGLP-1の分泌促進と、内臓感覚神経を介した脳作用によって、食べ過ぎ・ダラダラ食い・食後高血糖・肥満を改善する   肥満は、糖尿病や高血圧などの生活習慣病発症の主たる原因となります。肥満の予防・治療のための食事法として、サラダなどのボリュームがあり低カロリーな食品から食べ始める方法が推奨されています。この機序として、胃腸の伸展が満腹感を誘導するという先行研究がありますが、その詳細なメカニズムは概ね不明でした。胃腸伸展の生理機能解析研究が立ち遅れていた理由の1つに、実験的に胃腸を伸展させる方法に問題がありました。これまでの胃腸伸展法としては、外科手術を用いて胃腸内に風船等を入れる方法が一般的で、これら外科手術がその後の生理的な行動解析(食行動や糖代謝解析)に制限をかけていました。 今回、京都府立大学大学院生命環境科学研究科の岩﨑有作教授と大学院生の大林健人らのチームは、関西電力医学研究所矢田俊彦部長、大正製薬株式会社との共同研究で、胃の酸性条件下でゲル状の気泡を形成する「ペクチン含有炭酸水」を用いて胃腸を伸展させ、胃腸伸展による満腹感誘導作用とインスリン作用の増強による食後高血糖改善作用を、マウスを用いた実験によって明らかにしました [概要図]2010年から我が国で新しく利用されている糖尿病治療薬のGLP-1受容体作動薬は、腸ホルモンGLP-1(グルカゴン様ペプチド-1)を鋳型とした製剤です。今回発見した胃腸伸展による生理作用のメカニズムに、胃腸伸展によるGLP-1分泌の促進が大きく関与していることが分かりました [概要図]。さらに、GLP-1が内臓感覚神経(求心性迷走神経)を介して脳神経系に作用することも重要でありました。満腹感を誘導するペクチン含有炭酸水を、肥満マウスへ毎日与えると、ダラダラ食い(摂食リズム異常)を是正し、肥満を改善しました [概要図]。 本成果は、胃腸伸展刺激が肥満や糖尿病治療に有効であること、さらに、その作用メカニズムの一端を明らかとしました。本作用メカニズムを応用した新たな肥満・糖尿病の予防・治療法(機能性食品、薬)の開発が今後期待されます。 本研究成果は、202168日にスイスのオンライン学術雑誌「Frontiers in Endocrinology」誌に掲載されました。     著者:Kento Ohbayashi, Yukiko Oyama, Chiharu Yamaguchi, Toshiki Asano, Toshihiko Yada, Yusaku Iwasaki 論文名:Gastrointestinal distension by pectin-containing carbonated solution suppresses food intake and enhances glucose tolerance via GLP-1 secretion and vagal afferent activation. 雑誌:Frontiers in Endocrinology, 12:6768695 (2021) URL:https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fendo.2021.676869/full

2021.06.11 熊本大学と分子栄養学研究室の共同研究の成果が米国の科学誌Science Advancesに掲載されました

熊本大学と分子栄養学研究室の共同研究の成果が米国の科学誌Science Advancesに掲載されました。
難治性筋疾患である筋ジストロフィーはいくつかの病型があり,脆弱化する筋肉の身体位置は病型によってそれぞれ異なります。また,サルコペニアとよばれる加齢による筋肉の脆弱化も身体位置の特異性があります。しかし,一見同じようにみえる筋肉になぜ位置特異的な症状が出るのかは全く分かっていません。本研究では、骨格筋(筋肉)およびその再生を担う筋幹細胞は,身体位置固有の情報(位置記憶)を保持していることを発見しました。今後は、位置記憶の機能的な側面から筋疾患のメカニズム解明に取り組むとともに,位置記憶を応用した新たな筋再生治療の開発を進めていきます。京都府立大学分子栄養学研究室は、骨格筋の網羅的なDNAメチル化解析を分担しました。
 
論文・プレスリリースへのリンク
https://www.kumamoto-u.ac.jp/whatsnew/seimei/20210610

2021.06.07 動物機能学研究室の大学院生が、学会で受賞しました

202165日(土)にオンラインにて開催された「日本農芸化学会関西支部第515回講演会」において、動物機能学研究室所属の大学院生 大林健人さんが優秀発表賞(支部長推薦)を受賞しました。下記のとおり報告いたします。   受賞者 大林 健人(京都府立大学大学院 生命環境科学研究科 博士前期課程2年)   受賞題目 「ペクチン含有炭酸水の胃腸拡張によるGLP-1分泌促進と摂食リズム異常改善作用」   関連Webサイト(日本農芸化学会関西支部第515回講演会) http://kansai.jsbba.or.jp/presentation/2021年度支部講演会/515講演会.html

2021.04.20 遺伝子組換えによる「八重咲きのキク」の作出に成功しました(植物育種学研究室)

キクの雄ずいと心皮の形成を制御している2種類のクラスC遺伝子(CAG1CAG2)の機能を遺伝子組換え技術を用いて同時に抑制することで、これらの器官が花弁に変化した「八重咲きのキク」の作出に世界で初めて成功しました。頭状花序を持つキクでは花弁のように見える舌状花(個々が一つの花)で退化して見えなくなっていた雄ずいが5枚の細い花弁になって露呈するため、一般的な八重の花とは異なる独特の華やかな印象を与えるようになりました。クラスC遺伝子の機能抑制による雄ずいや雌ずいの花弁化は花卉の不稔化技術としてもその利用が期待されています。 本研究は,農研機構・佐々木克友 博士らとの共同研究によるものです。論文は2021年4月13日に科学雑誌Plantaに掲載されました。
<論文情報>
Katsutomo Sasaki, Satoshi Yoshioka, Ryutaro Aida & Norihiro Ohtsubo (2021) Production of petaloid phenotype in the reproductive organs of compound flowerheads by the co-suppression of class-C genes in hexaploid Chrysanthemum morifoliumPlanta 253: Article number: 100
PMID: 33847818 DOI: 10.1007/s00425-021-03605-4 
 

2021.03.20 コムギの桴色を決める遺伝子Rg-B1を単離・同定するとともに、スペルト小麦の起源を明らかに(植物育種学研究室)

コムギの桴(ふ)色とは穂の外観の色のことですが、この桴色を決める遺伝子Rg-B1は、コムギのグルテンの構成要素の一つである低分子量グルテニンサブユニットをコードするGlu-B3遺伝子座の遺伝子型識別のための圃場マーカーとして利用されてきました。   植物育種学研究室の半田裕一教授と4回生の森田匠くんのグループは、サウジアラビア、スイス、アメリカの研究者と共同して、コムギの桴色遺伝子Rg-B1を単離・同定し、その実体はMYB転写因子であることを明らかにしました。 また、その遺伝子解析を通じてオーガニック食品として欧米で人気のあるスペルト小麦の起源を明らかにし、その成果をCommunications Biologyに掲載しました。     論文タイトル: Population genomics and haplotype analysis in spelt and bread wheat identifies a gene regulating glume color Communications Biology 4: 375 (2021). https://www.nature.com/articles/s42003-021-01908-6.pdf 論文リンクはこちら        

2021.03.08 アサガオの花びら(花冠)がまっすぐに伸びる力学的な仕組みを解明(細胞工学研究室)

京都府立大学の武田征士准教授(細胞工学研究室)、奈良先端科学技術大学院大学の津川暁特任助教(植物代謝制御研究室)らの共同研究グループは、江戸時代から知られている変化アサガオのひとつで、花びらが折れ曲がる「台咲(だいざき)」系統を材料に、花びらがまっすぐに伸びる力学的な仕組みを明らかにしました。花器官表面にあるミクロ構造「分泌腺毛」が、器官どうしの摩擦を軽減することで、狭いつぼみの中でも花びらが伸長できることが分かりました。この仕組みを応用し、観賞用の花の形を自在に制御する園芸技術につながる可能性があります。   プレスリリース原稿はこちら     1 野生型(左)と 台咲(右)の花  野生型では花弁がまっすぐ伸長して漏斗状になる。台咲では花弁が2度折れ曲がり、花の中央に筒状の「台」と呼ばれる構造を作る   花びら伸長のメカニズム  野生型(左)では分泌腺毛とそこからの分泌物によってまっすぐ伸びる。台咲(右)では分泌腺毛がなく、花びらに摩擦が生じ、曲がってしまう。   【研究のポイント】 〇 江戸時代(1815年)に記載された変化アサガオのひとつで、花びら(花冠)の筒部分が折れ曲がる「台咲(だいざき)」系統を材料に、花びら伸長のメカニズムを研究しました 〇 花弁とがく片の表面にある分泌腺毛が、花器官どうしの摩擦を軽減することで、狭いつぼみの中で花びら(花冠)がまっすぐに伸長できることが分かりました。 〇 分泌腺毛の役割として、病害虫に対する物理・化学的防御が広く知られていましたが、今回の研究によって「花器官どうしの摩擦の軽減」という力学的機能が初めて示されました 〇 分泌腺毛というミクロ構造が、花びらの形づくりというマクロな過程に重要な役割を果たすことが分かりました。植物表面のミクロ構造を改良することで、花の形を改良できることが示唆されました。   【責任著者コメント】 今回、日本の伝統園芸植物のひとつであるアサガオの研究により、「花弁をまっすぐ伸ばす」という、一見当たり前のような事が、植物の積極的なメカニズムによって制御されることが分かりました。「変化アサガオ」にはまだまだたくさんの種類があり、日本ならではの研究に結びつく宝が埋もれています。国際化・オンラインネットワークにより世界中とつながることのできる今こそ、日本の歴史が蓄積してきた足元の宝に目を向けるのも、とても大事だと考えています。また、新型コロナウイルスで人々の心がすさんでいきがちですが、こういう時こそ、この研究成果によって、花をみて心癒される人が増えるよう、また、皆さんの花(植物)への関心が高まりますよう、心より願っております。 (京都府立大学 武田征士)   【論文情報】 本研究成果は、国際学術誌「Communications Biology」に、令和3年3月5日10時 (GMT)に掲載されます。 論文タイトル:Reduction in organ-organ friction is critical for corolla elongation in morning glory. 著者:Ayaka Shimoki, Satoru Tsugawa, Keiichiro Ohashi, Masahito Toda, Akiteru Maeno, Tomoaki Sakamoto, Seisuke Kimura, Takashi Nobusawa, Mika Nagao, Eiji Nitasaka, Taku Demura, Kiyotaka Okada, Seiji Takeda. doi. 10.1038/s42003-021-01814-x   【研究体制】
  •  京都府立大学大学院生命環境科学研究科 細胞工学研究室
准教授 武田征士          大学院生 下木彩香、大橋恵一郎、戸田真人        学部4回生 長尾実果
  •  奈良先端科学技術大学院大学 先端科学技術研究科 バイオサイエンス領域 植物代謝制御研究室
教授 出村拓              特任助教 津川暁
  •  国立遺伝学研究所 生物遺伝資源センター 植物育成開発支援部門
技術専門職員 前野哲輝
  •  京都産業大学 生命科学部 産業生命科学科
教授 木村成介            博士研究員 坂本智昭
  •  広島大学大学院統合生命科学研究科 附属植物遺伝子保管実験施設
助教 信澤岳
  •  九州大学大学院理学研究院生物科学部門 植物多様性ゲノム学研究室
准教授 仁田坂英二
  •  龍谷大学 農学部
教授 岡田清孝  

2021.02.24 学科教員が日本農芸化学会関西支部 支部技術賞を受賞しました

本学の教員が、2020年度 日本農芸化学会関西支部 支部技術賞 を受賞しました   受賞者 生命環境科学研究科 応用生命科学専攻 教授 増村 威宏 生命環境科学研究科 応用生命科学専攻 准教授 中村 貴子 (ほか2名 黄桜株式会社 若井 芳則、地方独立行政法人 京都市産業技術研究所 清野 珠美)   受賞内容 2020年度 日本農芸化学会関西支部 支部技術賞 (日本農芸化学会 関西支部主催)   受賞研究題目 「京都産米「京の輝き」、京都酵母「京の恋」を用いた大学オリジナル日本酒「なからぎ」の開発」   ○ 受賞(研究)の業績要旨 京都府立大学のACTRの仕組みにより、京都府立大学、京都府及び伏見酒造組合等と連携し、新しい酒造原料米候補の特性に関する研究を2012年度から行ってきた。京都府立大学はタンパク質分析を担当し、各機関と協力し、新品種が大粒・多収で高温耐性を有し、溶解性が良好・低タンパク質で酒造適性が高いことを明らかにした。このことから京都府による新品種米の登録に繋がり、「京の輝き」と命名され2014年5月に品種登録された。 この「京の輝き」を用いた日本酒の商品化を目指し、2014年度から黄桜株式会社と京都府立大学で共同開発を行った。「京の輝き」を100%使い、京都伏見の地下水と低温長期発酵による吟醸仕込で醸造、命名からデザイン、販売企画まで京都府立大学で主導し、京都府立大学オリジナル酒・純米吟醸「なからぎ」が開発され、2015年1月から販売された。 2020年に入り、(地独)京都市産業技術研究所から京都酵母「京の恋」を使った、オリジナル日本酒の共同開発の提案があり、これまでの「なからぎ」をベースに、京都酵母「京の恋」を採用し、新しい味を開発した。同時に、2015年からの販売過程で課題となった瓶の透光性が高いものから低い緑色の瓶へ変更するなどした。若い層にも親しみやすい日本酒となるよう、より芳醇な香りと爽やかな酸味の味わいに仕上がり、リニューアルされた。 以上のような産学公連携による共同研究およびその研究成果、商品化された全過程が受賞の対象となった。   (参考) 日本農芸化学会関西支部 支部技術賞について 個人、団体またはそれらの連名によるグループ(4候補者以内)で開発した優れた農芸化学関連技術について表彰するもの (年間で2件以内) http://kansai.jsbba.or.jp/technological-development/2020%e5%b9%b4%e5%ba%a6%e6%94%af%e9%83%a8%e6%8a%80%e8%a1%93%e8%b3%9e/2020%e5%b9%b4%e5%ba%a6%e3%80%80%e6%94%af%e9%83%a8%e6%8a%80%e8%a1%93%e8%b3%9e%e3%80%80%e7%99%ba%e8%a1%a8.html
 

2021.01.04 サギソウの多様性調査の論文が掲載されました(細胞工学研究室)

農学生命科学科・細胞工学研究室の武田准教授のグループは、近畿エリアの自生サギソウについて、花弁の形態とDNAマーカーを用いた多様性の調査を行い、論文として発表しました。 サギソウは湿地に生息する野生ランで、飛ぶ鳥のような形をした特徴的な花弁は、古来から人々を魅了してきました。しかしながら、湿地減少に伴ってその数は激減し、現在では絶滅危惧種(NT)に指定されています。 武田准教授のグループは、近畿エリアで維持・栽培されているサギソウについて、花弁形態の定量化とDNAマーカーによる遺伝的多様性の調査を行いました。この結果、花弁形態に地域の特徴があることや、地域によっては遺伝的多様性が低く、絶滅の危険性が高いことが分かりました。 花弁形態の定量化とDNAマーカーの利用により、自生地個体群の多様性調査が可能になり、保全の指標となります。他の残された自生個体についても多様性を把握し、保全につなげていきたいと考えています。     T. Tachibana, Y. Nishikawa, N. Kubo, S. Takeda (2020) Morphological and genetic diversities of Habenaria radiata (Orchidaceae) in the Kinki Area, Japan. International Journal of Molecular Sciences 22 (1), 331 doi:10.3390/ijms22010311   論文リンク        

2020.11.26 生命環境科学研究科半田教授が参加した国際共同研究グループの研究成果がNatureに掲載されました

世界のコムギ15品種の高精度ゲノム解読に成功   生命環境科学研究科半田教授が参加した横浜市立大学、国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構、京都大学等から成る研究グループは、世界10か国の国際共同研究である「国際コムギ10+ ゲノムプロジェクト」にて、日本のコムギ品種農林61号など、世界のコムギ15品種のゲノム解読に成功し、その成果が11月26日にNatureにオンライン掲載されました。 コムギは、イネ・トウモロコシとならぶ世界三大穀物ですが、実用品種のゲノム配列情報が不足しており、ゲノム配列の比較解析や、ゲノム情報を利用した現代的な分子育種への展開が遅れていました。今回、de novoゲノムアセンブリというゲノム解析技術を用いることで、初めて、15の実用品種について高精度のゲノム配列を得ることに成功しました。これにより分子育種技術の開発に欠かせない品種間差についての比較ゲノム・進化ゲノム解析が可能となりました。今後、ゲノム情報を活用したコムギの育種研究や品種改良が、国内外で飛躍的に進むと期待されます。その中でも日本チームが解読を担当した「農林61号」はゲノム配列が決定された欧米の他の品種群と配列が大きく異なるため、アジアのコムギ品種の参照ゲノムとして広く利用されていくと考えられます。 また、国際プロジェクトの成果とは別に、「農林61号」の詳細なゲノム情報解析に関する論文が、11月27日Plant and Cell Physiologyにオンライン掲載される予定です。   プレスリリースはこちらhttps://www.jst.go.jp/pr/announce/20201126-2/index.html   論文タイトル: Multiple wheat genomes reveal global variation in modern breeding Nature (2020). https://doi.org/10.1038/s41586-020-2961-x   De novo genome assembly of the Japanese wheat cultivar Norin 61 highlights functional variation in flowering time and Fusarium resistance genes in East Asian genotypes Plant and Cell Physiology (2020). https://doi.org/10.1093/pcp/pcaa152

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